Utiliser les modules
L’utilisation des modules permet de compléter très simplement un certain nombre de variables d’environnement telles que $PATH, $LD_LIBRARY_PATH
Pour chaque application / bibliothèque disponible sur le cluster, vous trouverez donc un module à charger pour pouvoir l’utiliser. Les modules ont pour nom : <nom_application>/<version>
Les modules sont gérés de façon hiérarchique :
les modules qui ne dépendent de rien
les modules qui dépendent d’un compilateur
les modules qui dépendent d’un couple (compilateur – MPI)
Ainsi
si aucun module n’est chargé, la commande module avail donne la liste des modules qui ne dépendent de rien.
Si vous chargez un compilateur, la commande module avail donne la liste des modules qui dépendent de ce compilateur.
Si vous chargez un compilateur et un module MPI, la commande module avail donne la liste des modules qui dépendent de ce couple (compilateur – MPI)
Lors du chargement d’un module, si la version n’est pas spécifiée alors c’est la version par défaut qui sera utilisée. Voici les * commandes de base de la commande module :
module spider |
liste tous les modules disponibles indépendamment des dépendances |
module spider r/4.0 |
liste tous les modules nécessaires au fonctionnement du module r/4.0 |
module avail |
liste tous les modules disponibles en fonction des modules déjà chargés |
module list |
liste tous les modules chargés par l’utilisateur |
module load/unload openmpi/4.1 |
|
module whatis < nom module > |
description synthétique du module |
module help |
aide sur la syntaxe |
module purge |
décharge tous les modules |
module load gcc/10.2 openmpi/4.1 |
pour un démarrage rapide vous pouvez charger les modules gcc/10.2 et openmpi/4.1 |