Journée

12e journée

12e journée du projet CaSciModOT
le 01 juillet 2010 à l'INRA - Centre de Tours - Nouzilly

XII Organisateurs de la journée : Anne Duittoz et Stéphane Cordier

Programme
  • 9h30-10h15 Accueil des participants
  • 10h15-11h00 Antti Niemi (LMPT, Tours)
    Protein folding as a theoretical and computational challenge
  • 11h00-11h30 Session ''démo'' : les présentations rapides des sessions ''démo'' donne une idée sur les domaines d'applications et les possibilités d'un logiciel. Suivant l'intérêt suscité, une version longue sera organisée dans le cadre de l'atelier-développeurs.
    • Thomas Haberkorn (MAPMO, Orléans)
      IPOPT (présentation)
    • Olivier Delestre (INRA, Orléans)
      PEST (présentation)
  • 11h30-11h45 Pause
  • 11h45-12h30 Ivan Fedioun (ICARE, Orléans)
    Approche MILES pour les écoulements compressibles, multiespèces et réactifs
  • 12h30-14h00 Déjeuner sur le centre de l'INRA
  • 14h00-14h45 Norbert Garnier (CBM, Orléans)
    Simulations numériques de bio molécules
  • 14h45-15h15 Session ''démo''
    • Didier Chauveau (MAPMO, Orléans)
      le logiciel R (présentation)
    • Matthieu Exbrayat (LIFO, Orléans)
      Explorer3D (présentation)
  • 15h15-16h00 Géraldine Pascal (INRA, Tours)
    Phyleas Prog: pipeline pour l'analyse de l'évolution des gènes
  • 16h00-17h00 Informations sur les projets
    • Le Centre de Calcul Scientifique en région Centre (CCSC) : bilan après un an d'utilisation
    • Présentation des projets du Cluster pour le prochain quadriennal
Journée

13e journée

13e journée du projet CaSciModOT le 01 juillet 2010
le 01 juillet 2010, auditorium Charles Sadron, déléguation régionale, campus CNRS d'Orléans

Organisateurs de la journée : Stéphane Cordier, Jean-Louis Rouet

Programme

  • 9h30-10h00 Accueil des participants
  • 10h00-10h45 Pascal Mignerot (CEA Le Ripault, Tours)
    Accès aux moyens de calcul CEA en région Centre
  • 10h45-11h05 Masoomeh Taghipoor (LMPT, Tours)
    Modélisation de la digestion dans l'intestin Grèle
  • 11h05-11h30 Pause
  • 11h30-12h00 Dans le cadre de l'inauguration du CCSC ''2 exemples de son utilisation''
    • 11h30-11h45 Michel Pirre (LPC2E, Orléans)
      Modélisation 3D à l'échelle régionale des processus physique et chimique de l'atmosphère terrestre
    • 11h45-12h00 Sylvian Cadars, Thomas Poumeyrol, Pierre Florian, Jonathan Yates, Franck Fayon et Dominique Massiot (CEMHTI, Orléans)
      Modélisation Moléculaire et Calculs de Spectres de Résonance Magnétique Nucléaire pour la Caractérisation des Matériaux
  • 12h00-13h00 Inauguration du Centre de Calcul Scientifique en région Centre (CCSC), accueil par Mme E. Vergès, directrice de l'OSUC, inauguration en présence de M. P. Riehl, vice-président de la Région Centre, chargé de l'enseignement supérieur, de la recherche et des formations sanitaires et sociales
  • 13h00-14h30 Déjeuner au restaurant du CNRS
  • 14h30-15h15 Francesco Piazza (CBM, Orléans)
    Modèles gros grains de la dynamique des protéines
  • 15h30-16h00 Session ''démo''
    • Léonard De Izara (ISTO et ICARE, Orléans)
      Maxima
  • 16h00-16h45 Fabrice Dupros (BRGM, Orléans)
    Modélisation sismique sur architectures multicoeurs
Journée

29e journée

29e journée du projet CaSciModOT
le mercredi 12 décembre 2018, au Fond Régional d'Art Contemporain à Orléans, à l'occasion de l'exposition Madrid, Octobre 68

Organisateur de la journée : Sophie Robert, Stéphane Cordier, Jean-Louis Rouet.

L'après-midi de cette journée est consacrée au thème “Algorithmique, numérique, IA et arts”, invité Marc Schoenaeur.

Programme
  • 9h30 Accueil des participants
  • 10h00--10h30 Cyrien Soulaine (BRGM, Orléans)
    Digital Rock Physics
  • 10h30--11h00 Noémie Gaveau (FDP, Orléans)
    <--> Un modèle de transfert pour la modélisation de l'érosion
  • 11h00--11h30 Pause
  • 11h30--12h00 Frédéric Gosselin (IRSTEA, Nogent/Vernisson)
    Utilisations et développements de modèles statistiques pour analyser les relations entre les variables de biodiversit´ et de gestion forestière
  • 12h00--12h30 (Frac, Orléans)
    <--> Introduction à l'exposition Madrid 1968
  • 12h30--14h30 Buffet et visite de l'exposition Madrid 68
  • 14h30--15h30 Marc Schoenaeur (INRIA, Saclay)
    Intelligence Artificielle, hier, aujourd'hui demain
  • 15h30--16h00 Christel Vrain (Lifo, Orléans)
    Intelligence Artificielle et Machine Learning
  • 16h00--16h30 Romain Raveaux (LiFat, Tours)
    <--> Quelle IA pour les données structurées ?
  • 16h30--17h00 Conclusions de la journée
Journée

30e journée

30e journée du projet CaSciModOT
le Jeudi 04 juillet 2019, à la Cité de la Création et de l'Innovation MAME 49 boulevard Preuilly 37000 Tours

Organisateur de la journée : Romain Yvinec.

Le thème d'une partie de la journée a porté sur la “Recherche et Innovation dans les nouvelles technologies du numériques". Le reste de la journée sera consacrée comme à l'accoutumée au partage d'expériences autour de la modélisation et de la simulation numérique. Cette journée sera en partenariat avec la cité de la Création et de l'innovation MAME, ainsi que le Funlab.

Programme
  • 9h15-9h30 Accueil
  • 9h30-10h10 Présentation des réseaux académiques, du monde de l'entreprise et institutionnels autour du numérique : MAME, CaSciModOT, CCSC, GSON, CRNUM
  • 10h10--10h30 Lacthida Boumeddane (Les 3 Dimensions)
    L'impression 3D accessible à tous
  • 10h30--11h00 Aurélien Jeanjean (La Fabrique d'Usages Numériques)
    Expérimentation & Automate cellulaire
  • 11h00--11h30 Pause
  • 11h30--12h00 Fernando Guerrieri (IRBI, Université de Tours)
    De la fabrication numérique pour étudier le comportement des petits animaux
  • 12h00-12h15 Catherine Lenoble (La Fabrique d'Usages Numériques)
    Présentation du FUNLAB: Fabrique d'usages numériques
  • 12h15--13h50 Buffet / visite du FUNLAB
  • 13h50--14h10 Christophe Tavan (OSITRADE)
    Ositrade, la solution blockchain pour le commerce de grains
  • 14h10--14h40 Meissa M'Baye (LMJL, Université de Nantes)
    Deux nouveaux schémas numériques pour la simulation d'écoulement fluidiques avec FULLSWOF (Full Shallow Water equations for Overland Flow)
  • 14h40--15h00 Michaël Savary (AQUASYS)
    Gérez efficacement la ressource en eau
  • 15h00--15h30 Pause
  • 15h30--16h00 Samia Aci-Sèche (ICOA, CNRS)
    In silico developments for kinase drug discovery
  • 16h00--16h30 Sewpersad Sunaina (LAME, INSA Centre-Val-de-Loire)
    Optimisation par essaim de particules appliquée à la détection de modifications structurelles d'une structure vibrante
  • 16h30--17h00 Dominique Nelson-Gruel (PRISME, Université d’Orléans)
    Estimation de température catalyseur de véhicule
Journée

31e journée

31e journée du projet CaSciModOT
le Mardi 17 décembre 2019, amphi Herbrand, bâtiment IIIA, UFR faculté des Sciences et Techniques, Université d'Orléans

Organisateur de la journée : Sébastien limet et Jean-Louis Rouet.

Cette  journée coïncide avec les 10 ans du CCSC. Aussi, elle sera axée calcul scientifique, de demain et d'aujourd'hui, avec des focus  sur les machines de demain et leur programmation, l'utilisation de logiciels et, comme à l'accoutumée, un partage d'expériences autour de la modélisation et de la simulation numérique.

Programme

  • 9h30 Accueil des participants
  • 10h00--10h45 Nicolas Ollinger (LIFO, Orléans)
    Qubits et portes quantiques : premiers pas en informatique quantique
  • 10h45--11h45 Gerald Kneller (CBM, Orléans)
    Nouveaux paradigmes pour l’analyse de données provenant des grands instruments
  • 11h45--12h15 Cyprien Soulaine (ISTO, Orléans)
    OpenFoam
  • 12h15--13h45 Buffet
  • 13h45--14h15 Ambroise de Izarra (Greman, Tours)
    Condensation de l'ADN
  • 14h15--15h15 Dominique Nelson-Gruel (PRISME, Université d’Orléans)
    Estimation de température catalyseur de véhicule
  • 15h15--15h45 Jean-Louis Rouet (ISTO, Orléans)
    Les 10 ans du CCSC
  • 15h45--16h15 Conclusions de la journée
Journée

23e journée

23e journée du projet CaSciModOT
le jeudi 10 décembre 2015, à l'université de d'Orléans, amphitéâtre de l'IRD, 5 rue du carbone.

Programme

  • 9h30 Accueil des participants
  • 10h00--10h30 Amina Nouhou-Bako (INRA, Orléans)
    Un modèle èrosion diffuse des sols : prise en compte de l'intéraction gouttes – écoulement
  • 10h30--11h00 Romain Yvinec (INRA, Tours)
    Is it possible to obtain reliable parameter values using parameter optimisation in dynamical models for systems biology?
  • 11h00--11h20 Pause
  • 11h20--12h50 Samia Aci-Sèche (ICOA, Orléans)
    Structural bioinformatics and chemoinformatics for kinase drug discovery
  • 12h50--12h20 Jacqueline Lafont-Terranova (LLL, Orléans)
    Modéliser le processus d'écriture pour accompagner les pratiques d'écriture à l'université
  • 12h20--14h00 déjeuner
  • Après-midi SPÉCIAL PYTHON : une large place est donnée à la prise en main de Python. Apportez votre ordinateur sur lequel vous aurez installé Python 3 (par exemple la distribution anaconda 3.5).
  • 14h00--14h30 Pourquoi Python (Mathieu Liedloff, LIFO)
  • 14h30--15h15 Prise en main de Python (Vincent Perrollaz, LMPT)
  • 15h15--15h45 pause
  • 15h45--16h15 Notebook (Vincent Perrollaz, LMPT)
  • 16h15--16h45 Python et interface graphique (Denys Duchier, LIFO)
  • 16h45--17h15 Python et calcul scientifique (Thierry André et Song Zhao, ICARE)
  • 17h15 fin de la journée
Journée

24e journée

24e journée du projet CaSciModOT
le vendredi 17 juin 2016, à l'université de Tours, Amphithéâtre A50, UFR Sciences Pharmaceutiques

Organisateur de la journée : Romain Yvinec.

Une partie de cette journée sera consacrée à la présentation de R. Pour la présentation du langage R, vous êtes invités à apporter votre ordinateur portable sur lequel vous aurez installé une version de R au préalable (par exemple Rstudio, avec les paquets ade4 et mixtools via la commande R : install.packages("ade4") et install.packages("mixtools") ).

Programme
  • 9h30 Accueil des participants
  • 10h00--10h30 Anmar Khadra (McGill, Montreal, Canada)
    Modeling electrical activities of gonadotropin-releasing hormone neurons
  • 10h30--11h00 Arsene Ella (INRA, Tours)
    Construction of a probabilistic sheep brain model from high resolution MRI
  • 11h00--11h30 Pause
  • 11h30--12h30 Didier Chauveau (MAPMO, Orléans)
    mini cours "R" partie 1
  • 12h30--14h00 repas
  • 14h00--15h00 Didier Chauveau (MAPMO, Orléans)
    mini cours "R" partie 2
  • 15h00--15h30 Didier Chauveau (MAPMO, Orléans)
    Simulation based Nearest Neighbor entropy estimation for MCMC evaluation
  • 15h30--16h00 Pause
  • 16h00--16h30 Mindjid Maizia (Citeres)
    Modélisation toaster : exemple d'application à l'énergétique urbaine
  • 16h30--17h00 Julien Barré (MAPMO, Orléans)
    Modélisation de pièges magnéto-optiques
  • 17h00 fin de la journée
Journée

25e journée

25e journée du projet CaSciModOT
le lundi 12 décembre 2016 au BRGM (Orléans)

Une partie de cette journée a été consacrée au Big Data vu par les entreprises.

Organisateurs de la journée : Fabrice Dupros et Jean-Louis Rouet

Programme

  •   9h00 -  9h45 Café acueil des participants
  •   9h45 - 10h00 Mot d'accueil par François Robida – (BRGM)
  • 10h00 - 10h30 Konrad Hinsen (CBM, CNRS)
    Scientific notations for the digital era
  • Projet d'institut de Convergences ICON
  • 10h30 - 11h00 Patrick Darmon (Groupe ATOS)
    Big Data et apllications
  • 11h00 - 11h30 Pause
  • 11h30 - 12h00 Christophe Cerqueira (Ingensi, Groupe Cyres)
    Le big data et le calcul prédictif
  • 12h00 - 12h30 Denis Wouters (Cybeletech)
    Technologies du big data appliquées à l'agriculture
  • 12h30 - 14h00 repas
  • 14h00 - 14h30 Toko Kamtchueng (Université Orléans, ISTO et BRGM)
    Solution semi-analytique et approches numériques du transfert réactif dans un modèle de réseau de pores saturés en eau
  • 15h00 - 15h30 K. Bourgeois (LIFO, Université Orléans, Géohyd)
    Du calcul dynamique des bassins versants à un framework de parallélisme implicite pour les SIG
  • 15h30 - 16h00 Pause
  • 16h00 - 16h30 Florent De Martin et Faiza Boulahya (BRGM)
    Quantification des incertitudes en sismologie et Bigdata
  • 16h30 - 17h00 Stéphane Cordier (Université Orléans, MAPMO)
    Projet d'institut de Convergences ICON en présence d'A. Bruand, Président de l'Université d'Orléans
  • 17h00 - 17h15 : Clôture par Pierre Toulhoat (Directeur Scientifique du BRGM)
Journée

26e journée

26e journée du projet CaSciModOT
le jeudi 22 juin 2017, Faculté de médecine, site Tonnelé, Tours

Sur le thème : données de terrain et modèles, une interaction à double sens Organisateur de la journée : Sten Madec

Programme
  • 9h30 Accueil des participants
  • 9h55--10h30 Yann Jullian & Cécile Poisvert (CaSciModOT, GéHCO, Tours)
    Complétion et désagrégation de données agricoles pour un calcul de surplus azoté
  • 10h30--11h05 Nicolas Azzopardi, Sten Madec, David Ternant & Vincent Perrollaz (CHU & LMPT, Tours)
    Influence de la masse antigénique sur la pharmacocinétique des anticorps thérapeutiques et modèle TMDD et effet éponge
  • 11h05--11h40 Kevin Bourgeois (LIFO, Orléans)
    Efficient Implicit Parallel Patterns for Geographic Information System.
  • 11h40--12h15 Camille Coron (LMO, Paris)
    Estimation d'abondances relatives d'espèces à l'aide de données opportunistes
  • 12h15 repas et réunion comité
  • 14h00--14h35 Didier Mathieu (CEA, Tours)
    Propriétés physico-chimiques des composés organiques: modèles exploitant théories physiques et données empiriques/li>
  • 14h35--15h10 Thierry Dudok de Wit (LPCEE, Orléans)
    Mesure du rayonnement solaire par satellite : de la fusion de données en jonglant avec les incertitudes
  • 15h10 Pause
  • 15h30--16h05 Phillipe Gayral (IRBI, Tours)
    Découverte de nouveaux virus : l'apport des données de séquençage haut débit d'animaux non modèles pour comprendre l’évolution virale
  • 16h05--16h40 Thomas Duge De Bernonville (BBV, Tours)
    Réutilisation de données de séquençage de transcriptomes: création de larges données pour la compréhension de processus biologiques
  • 16h40--17h00 Informations CaSciModOT
  • 17h00 fin de la journée
Journée

27e journée

27e journée du projet CaSciModOT
le lundi 11 décembre 2017, à l'amphitéâtre de l'IRD, Université d'Orléans

Organisateur de la journée : Sophie Robert et Jean-Louis Rouet.

L'après-midi de cette journée est consacrée à l'Intelligence Artificielle.

Programme
  • 9h30 Accueil des participants
  • 10h00--10h30 Magali Ribot (MAPMO, Orléans)
    Quelques exemples de modèles mathématiques pour la biologie
  • 10h30--11h00 Hamidréza Ramézani (ICMN, Orléans)
    Calcul parallèle et simulation moléculaire d'adsorption dans les matériaux carbonés
  • 11h00--11h30 Pause
  • 11h30--12h00 Guillaume Richard (ISTO, Orléans)
    From Melt Percolation in the upper mantle to the Lithosphere Asthenosphere Boundary
  • 12h00--13h30 repas à l'Agora
  • 13h30--14h00 Matthieu Exbrayat (LIFO, Orléans)
    Une petite introduction à l'intelligence artificielle
  • 14h00--14h30 Vincent Labbé (BRGM, Orléans)
    Intelligence Artificielle & GéoSciences - cas d'étude : où chercher de l'or en Bretagne ? Retour d'expérience sur un concours de cartographie prédictive
  • 14h30--15h00 Anaïs Lefeuvre-Halftermeyer (LIFO, Orléans)
    Du traitement automatique du langage à l'IA
  • 15h00--15h30 Pause
  • 15h30--16h00 Moncef Hidane (LI, Tours)
    Multi-label classification using a map between sparse representations application to retinal blood vessel segmentation
  • 16h00--16h30 Aladine Chetouani (Prisme, Orléans)
    Reconnaissance automatique de motifs pour l'analyse archéologique de tessons céramiques
  • 16h30--17h00 Conclusions de la journée et informations sur ICON et GSON
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